Hola Mauricio
Por lo que estuve leyendo, tu problema es causado por la falta de caudal mas que otra cosa (recomiendo no modificar la mecanica ni forzar el funcionamiento del calefon ya que trabajaria exigido y acortaria su vida util)
Por lo que estuve viendo, te recomendaron una bomba presurizadora, Tambien te recomiendo una de esas bombas de la cual te explíco, No hace falta tanque de reserva para que ella trabaje (la bomba) puede ir colocada en la entrada o alimentacion de agua en la casa, directamente a la cañeria de agua corriente, antes de preparar un tanque de 125 lts que creo estas planeando, llama a tu tecnico y pidele que coloque la bomba presurizadora en la cañeria de alimentacion a tu casa, a la hora de regular la presion de trabajo, regúlala como para que en horarios de baja presion, ésta llegue hasta la tercer planta de tu casa, repito, no hace falta sisterna para que una bomba presurizadora pueda trabajar. Las empresas fabricantes ofrecen estas opciones para no perjudicar a los demas vecinos ya que, si colocas la bomba presurizadora en la red de entrada a tu casa, seria una instalacion directa y al comenzar a trabajar la bomba succionaria el agua desde el "acueducto" reduciendo aun mas la presion en las casas vecinas, por eso las empresas no dicen que SI puede ir la bomba conectada directamente a la cañeria de alimentacion. Trata de no modificar muchas cosas en tu calefon ya que puede ser peligroso, estas trabajando con gas natural.
Con respecto a tu consulta de que si se puede limpiar con vinagre un serpentin, Si, si se puede limpiar con vinagre ya que éste disuelve el sarro por una reaccion quimica casi natural, lo que tiene de malo, es que lleva mucho tiempo ese metodo de limpieza, algunos otros tecnicos limpian con algunos acidos que son algo peligrosos y no te recomiendo uses si no eres tecnico.
Un abrazo (Jose de San Juan)